序章新時代的開端
搜查總部大樓的角落裡，一個空寂的房間內放著一台孤零零的電腦。
電腦放在地板上，看起來並不是要為人使用而準備的，一座造型奇特的電子計時器與這台電腦連接。這無生命的道具感受不到主人離去的悲痛，只是在默默地履行著自己的責任。
記錄者一個不知名的時間倒數……
20天18小時31分31秒。
20天18小時31分30秒……
在另外的房間里，搜查本部的人多少已經擺脫了龍崎之死帶來的打擊。
逐漸從消沉的陰靈中走了出來。松田、模木和相澤坐在茶几邊的沙發上的竊竊私語。
月在遠離他們的一台電腦上忙著什麼。沒有人能看得到他的表情。
去除了最大的對手，接管了針對自己的調查組織的這個少年，終於站上世界的頂峰，成為了近似於神的存在。世界在他的掌控中！
完全意識不到自己的生命已經落入別人手中的三個搜查本部成員，毫無緊張感地閑聊著。
「還說呢，那個安德烈原來是個這麼厲害的發明家！」相澤拿著一份報紙，上面刊登了安德烈的仆告：「……曾獲得多項發明的專利權……在世界各地資助了許多的孤兒院等慈善機構……」
松田一臉崇敬的表情：「這真的是個偉人！是偉人啊！」
這時，從客廳門外響起一串沉重的腳步聲，夜神局長走了進來，自從龍崎死了之後，他就一直忙於向警視廳高層報告之前的情況，並極力掩飾L已死的現實。
「局長，您辛苦了。」松田向旁邊側了側身，給夜神局長讓出一個空地。
夜神總一郎走到沙發旁邊，重重地將自己疲憊的身體摔進沙發里。
相澤警探問道：「上面的反應怎麼樣？」
「唉……」夜神局長長嘆了一口氣：「他們說『雖然L以殺手的嫌疑拘捕了火口之後，罪犯被殺的現象確實停止了，可是只停止了四天。』所以上面認為這證實火口不是殺手。」
「那您是怎麼對他們說的？」松田問道。
「我說很快就能夠令真相大白，總算說服了他們讓我們繼續調查。但當時的情況……無論如何也能夠都告訴他們……如果L死了這件事讓他們知道，我們的調查肯定會被徹底終止。」
警探們面面相覷。「這不太像話了，高層的人只會擔心自己的安危。」
相澤聳了聳肩膀：「幸好只有我們這些人知道L和安德烈的真實身份。如果要讓上面放心讓我們認真查下去，他們兩人的死……唔，至少L的死要隱瞞，我們一定要假扮L。」
松田插嘴道：「或者等夜神局長成為警視總監以後。」
「L和安德烈不在了。」相澤遺憾地環顧四周：「我們也不太方便繼續使用這棟大樓了呀，這真是很棘手。」
夜神局長對一直默默地坐在客廳內大型電腦前面忙碌的夜神月說道：「阿月，趕得及么？」
「唔，我看沒問題。」夜神月按動了幾下按鈕，頭也不回地答道：「今晚之內，我會解開大部分的系統密碼，這就像是在偷東西一樣，我心裡實在是不怎麼舒服。」夜神月語氣一轉：「不過，這系統中的資料實在很豐富，我可以炮製龍崎曾經用過的東西和相同音頻的聲音，來假裝他仍然活著，就算是像他一樣指揮世界各地的警方行動也不在話下。問題是今後讓誰來代替L，在什麼地方展開調查以及怎麼處置死亡筆記。」
松田有些不滿地說道：「阿月你說什麼？L的位置只有你才能代替吧？」其他的人的表情說明，他們也有和松田相同的想法，夜神月局長看著兒子背影的目光中也透出了几絲驕傲與自豪。
夜神月的嘴角邊閃過一絲不易察覺的微笑，但語氣和之前一樣平淡：「龍崎，或者說L，他可是因為向殺手挑釁所以才被殺，想到這個，我實在是提不起勁兒來……而且這樣做，無疑是在欺騙全世界的人。」
相澤接過話頭：「我明白你的心情，但是只有阿月你才稱職，只有你才挑得起這副重擔啊！」
「對啊，龍崎不也說過么，阿月可以繼承L的。」
一切事物的發展都是按照夜神月之前的推斷而進行著，龍崎一死，夜神月就成了當然的領袖。
夜神月從電腦台前站起身來：「我知道了，不過我醜話說在前面，要是像龍崎那樣對殺手挑釁，冒生命危險去取得線索，我可做不到。如果你們覺得我這樣做可以的話，我答應代替L。」
夜神局長點點頭：「唔，我也覺得龍崎當時的挑釁過分了，慎重一點好。」大家也紛紛點頭同意。
「這樣的話，等我把這部電腦中的資料轉移到我自己的電腦上，就可以開始工作了，只要安裝了電波干擾器，在我的房間也可以使用。當然，媽媽和妹妹也在家裡的時候就比較難辦，不如就在外面租一間房子吧。」夜神月用詢問的眼神看著父親。
夜神局長點點頭：「你年紀也大了，我安排兒子出來生活也合情合理。」
松田笑著說：「對呀，這樣的話，以後阿月的房子就變成調查總部了，原先是因為龍崎懷疑我們之中有殺手存在，現在沒有這個懷疑，防護工作也不必這麼小心翼翼。」
相澤警探沉吟了一下：「安德烈的事情怎麼處理？」
「也由我來做吧。」
「什麼？」
「反正我也做了L的角色，再多扮演一個人也沒什麼區別，其實安德烈以往所作的多半是作為L的中間人，替龍崎與外面聯絡。其實就等於省去這個步驟。安德烈這個身份似乎連他的家人也不知道，只要機靈一點，隨機應變的話，沒有什麼困難。」
「那最後，如何處置死亡筆記？」相澤追問道。
「這也不難，只要在我們之中選擇一個絕對不會使用的人，由他收藏起來就好了。」
月剛說完這句話，所有的人都把目光投向夜神局長。
「我魅力而為吧。」夜神總一郎抿了抿嘴：「我會小心，死神冒出來的時候，不會呱呱大叫。」
「說到死神。」一直沒有發言的模木警探說道：「龍崎和安德烈一死，好象就全部消失了一樣。」
松田笑了笑：「以一個人類的想法去揣測死神，算了吧，別費那個腦子了。」
「問題是，殺手是如何得到龍崎的資料的？」
「死神都不在了，這線索也算是斷掉了耶！」
夜神月揮了一下手：「目前我們只確切知道兩件事情，一個是這這所有一切的根源是死神，另一個就是有一個人類從死神手中拿到了可以掌握他人生死的死亡筆記，並殺死了我們的朋友！」
夜神局長點點頭：「殺手是確實存在的，我們一頂要抓到他！」
調查總部的客廳中瀰漫著一股許久未見的活力！對於這種活力的理解，夜神月與其他人當然有著微妙的差別……
幾天後，夜神月、彌海沙在街上如情侶般地散著步，死神琉克張開黑色的翅膀在他們身後不遠盤旋著。街上的人對著他們指指點點，竊竊私語，當然不是因為他們看見了死神，更多的是彌海沙的擁護者。
「你這樣就算是和L分出勝負么？」
「沒錯！而且是阿月贏了！」彌海沙小聲地歡呼。
「那樣的話，再沒有有趣的東西可以期待了呀。」琉克意猶未盡地說道。
「沒那回事。」夜神月的語氣平靜而又堅定：「接下來，我會讓你看看我所創造的新世界！」
「呵呵，這倒也讓人期待……」
「……另外，人類這種生物十分地愚蠢，就算L死了，也不表示所有人會成為殺手的夥伴，第二場戰爭現在才開始啊！」
夜神月突然停下腳步，看著依偎在自己身邊的彌海沙：「海沙……」
「唔？」
「一起住吧？」
「真……真的么？」彌海沙有點不敢相信自己的耳朵。
「是的，我已經租好房子了。」
「呦喝！太好了！要開始同居了！不如我們搞一個彌海沙公開戀情記者招待會吧！」
「喂……這種事未免有點……」
「沒事，沒事，誰會想得到彌海沙的男友會是殺手呢！」
琉克抓了抓頭皮，他對彌海沙完全意識不到夜神月一直在利用她這一點感到十分地費解，其實他幾次想告訴彌海沙這一點，但因為這種關係在死神看來實在是有趣得很，才放棄了行動。
2005年1月10日，美國科羅拉多州，肯特家的次女，瑪麗?肯特因為摩托車失事