序章
波瀾起伏，連綿不絕。
偶爾在懸崖上激起一層浪花，又頃刻間化作碎片散去。
由風華鎮通往美星的一條沿海小路，中途，一處面向大海突出的岩石邊，夏樹獨自一人佇立在那裡，任憑漆黑的長髮迎著拂面而來的海風肆意飛揚。夕陽已漸漸西下，浸染了一身柔暖光芒的橙色制服，也在這海風的撥弄下徐徐飄動起來。
『媽媽……』
伴隨著一聲彷彿就要淹沒在風中的微弱低喃，夏樹閉上了眼睛，腦海里再度浮現出關於那一晚的記憶。努力想忘記，卻無論如何也忘不了的10年前的那個夜晚……
地處美星的岩境製藥研究所——在這間被自己稱為『媽媽的書房』的研究室內，等媽媽下班累了而陷入睡夢中的夏樹突然被母親叫醒。一向平和溫柔的媽媽，今天第一次露出了堅毅凝重的神色，發生了什麼事呢？經過一番近乎乞求的堅持，夏樹終於被允許帶著最好的朋友——小狗迪蘭一起坐進媽媽的車，在肅殺的黑夜中飛馳而去。
然後，就到了這個地方，『他們』等候多時的地方。
黑色西裝黑色太陽鏡，映入眼帘的是常常出入於岩境製藥研究所的『黑叔叔』們。雖然平日里總是如同默默守衛研究所一般安靜的佇立著，但有時也會和來等媽媽的夏樹一起悄悄地玩上一會兒，給點糖吃什麼的。印象中，叔叔們是有著這樣的一面的。
但此時，他們全都掛著一幅可怕的表情，站在那裡。
而這也是夏樹最後一次見到他們。
接下來的記憶已經無法拼成一組連貫的畫面了——車閘突然發出尖銳的叫聲，引著疾馳的車瘋了似的衝破了路邊的防護欄。突如其來的漂浮感和媽媽的悲鳴激起無邊的恐懼，腦子還來不及思考就……
那個時候，自己一定在呼喊著什麼吧。但那句話，如今已和迪蘭，以及媽媽的性命一起永遠的長眠於懸崖之下了。
『以前來過這裡？』突然從背後傳來的聲音打斷了夏樹的思緒。
『你才是，為什麼還留在這裡？一番地早就已經不存在了吧……迫水。』夏樹回答道。
『嗯。不過想在離開前和她打聲招呼……沒關係吧？』
迫水開治，風華學院教師，同時也是被稱為一番地的組織的精英成員——不，一個小人物。
『這個是種在學校花壇里的，也不知道她喜不喜歡……』他手裡拿著一束花。『很不湊巧，街上的花店都關門了。』
『隨你便吧。』
依然是冰冷的回答，但是迫水對此毫不在意，反而露出稍稍安心的微笑。他將花束投入了大海。
原本紮成一束的花，受到海浪的衝力頃刻鬆散開來，再隨著波濤相互激蕩一番，便很快消失了蹤影。
——就像我們一樣呢……
心懷寂寥地自言自語著，夏樹抬起目光朝向天空，視線落達之處，是一顆巨大的星星。
莫名其妙產生的高次元物質化能力，莫名其妙擁有了這一力量的少女-HIME，以及只有她們才能看到的紅色星球——媛星。
之前只是月亮旁邊的一個模糊微弱的光點，如今已經大到連細緻的紋路都看得一清二楚。它散發著令人畏懼的紅色光芒，彷彿在向身為HIME的夏樹本人以及存活至今的另外3名HIME昭示其終結的時刻。
是的，如今，一切都要結束了。
而夏樹的戰鬥，則開始於那個以HIME身分覺醒的夏末的夜晚。