在日本長崎的九州島，有一片茂密的森林，人跡罕至。一九八六年的夏季，一批考古學家為了考察一處古人類遺址，由隊長森川帶領，來到了這片森林地帶。
隊長森川走在隊伍的最前面。突然，前面不遠處的樹後發出「咔咔」的響聲，樹枝不停地晃動。他們趕緊停下腳步，森川透過望遠鏡，死死地盯著發出怪響的樹枝中間，隱約能看到許多不太大的黑影，在樹後移動。當森川定睛仔細看清了是什麼時，嚇得驚叫一聲，望遠鏡也扔到了地上。
驚恐萬狀的森川結結巴巴地對其他隊員描述剛才所看見的怪物：它們長得像人，披著長毛髮，但絕不是猩猩，因為它們的皮膚是深藍色的！
在事情沒有搞清楚之前，考古隊也不敢貿然行動。於是他們轉回東京，去尋求幫助。回到東京後，森川迫不及待地與好朋友鳥谷博士聯繫。鳥谷博士是位著名的生物學家，或許他會知道那怪物究竟是什麼東西。
聽完森川的描述，鳥谷博士也糊塗了，他也搞不清楚那是個什麼東西。「難道會是稀有人種，以前也沒聽說過什麼藍色人種呀？」好奇心十足的鳥谷博士決定自己組隊去那片森林考察，以探究「藍皮膚怪物」之謎。
森川擔任生物考察隊的嚮導，帶領鳥谷博士一行在九州島的那片林地中展開搜尋。剛開始幾天，他們什麼也沒找到，有的人甚至開始懷疑森川是不是看錯了，或是幻覺所致。
森川發誓他沒有看錯，事情是千真萬確的。幾天後，皇天不負有心人，森川他們終於找到了那群怪物！
起初，他們誰也不敢靠近那些怪物，它們實在是太可怕了：臉上長著一個鼓出來的如同雞蛋般的大眼包，眼睛如同一條細縫；沒有嘴唇，只剩下一條裂縫似的開口，在長鼻子的地方長了一塊疙疙瘩瘩的肉瘤。四肢又細又長，髒亂的毛髮黏在身上，像快要死去了一樣。
鳥谷博士實在想不出這群像人又非人的怪物是什麼。他們試著向怪物靠近，發現怪物並沒有他們想像的那麼可怕，只是獃獃地咀嚼著手中的嫩葉和野果，聽憑考察隊員把它們抓住，不掙扎，不嚎叫。
鳥谷博士試著和它們講話，大多數怪物對此毫無反應，繼續吃東西。但是，鳥谷博士發現，其中有極少數的幾個對他講的話作出了反應，他們衝鳥谷博士搖了搖頭！
「他們是人！他們能聽懂我講的話！」驚喜交加的鳥谷博士不禁大叫起來，趕忙叫隊員拿食物給他們吃。
消息很快傳到東京，傳遍日本。因為怪人的外觀很醜，像隻蟲子，所以科學家們為之命名「昆蟲人」。
對「昆蟲人」的研究結果使日本科學家感到無比的痛心。原來，造成這群「昆蟲人」的始作俑者，竟是原子彈！
事情要回到二戰結束時。一九四五年，美國為敦促日本投降，盡快結束戰爭，分別在廣島和長崎各投放了一顆原子彈。當蘑菇雲在長崎騰空升起，整個長崎地動山搖。這群當時只有十來歲的孩子，以為世界末日到來了，於是，驚恐地逃到附近的這片森林中。原子彈不僅使他們失去了美麗的家園和可愛的親人，大量放射性物質還侵蝕了他們的身體、毀壞了他們的健康孩子們，不但喪失了生活的能力，還變成了這副可怕的怪模樣。