北條皇子是在北條皇斗即位半年後和戀歌還有衛梨珠一同消失後，這樣足足的過了1年後才出生的。
他出生就有著成為皇帝的宿命。
父親北條皇斗，母親北條花戀。
就這樣被教育著的他，並不知道父母的溫暖，是個只有名字的存在。
實際上也是作為宇堂夫婦的樣子長大的皇子郎，心中的父母則是其他人。
宇堂的女兒就像對著哥哥一樣純粹的崇敬著他，就這樣正直的成長著的皇子郎。
但是，在皇子郎16歲的冬天。
他知道了自己出生的秘密。
看到了「母親」北條花戀持有的【那個東西】。
北條皇子郎，出生的秘密。
其實就是，他並不是北條花戀生的這樣的事實。（花戀那個時候小的，就算一斗那個時候上了過了1年能生出你才怪啊。）
他在哪天被告知了自己其實是花戀的祖父北條皇子的克隆人。
皇子郎的精神崩潰了。
拯救這樣一個有著至尊的王冠心靈缺墮入黑暗的皇帝的是，他一直以來走位妹妹挨著的少女，宇堂八重。
這個少女，之後就成了皇子郎的王妃，那個時候的帝國，可以說是被她對皇子的愛所拯救的。
小時就受到了聖騎士巴御劍的熏陶，並且從大賢者璃貴弗洛斯特·懷特那裡學習帝王學的皇子郎，在皇妃的支持下執行著作為皇帝無可挑剔的政治。
雖然皇子郎的孩子誕生了，孫子也誕生了，但是由於特殊的體制誕生的，他的子孫代代都很短命。
帝國曆77年
從今天算的話也就是5年前。
就算是皇子郎，也開始意識到慢慢迫近的死亡的陰影。
對於他來說，唯一的希望就是曾孫北條愛戀。
這個時候愛戀12歲。
【在這樣的滿是怪蟲的世界，這樣的孩子要一個人留下的話…】
只有這個是皇子郎不停的苦惱的地方。
不過沒想到他是個有創造性的男人，這樣的創造性和對曾孫的北條花戀所有抱有的思念一樣的強大。
在同時學習了帝王學和魔法學的皇子郎，但是還沒辦法用自己的魔力使用魔法，為了學習魔法理論成為了懷特的弟子，就這樣得到了必要的知識。
以這個魔法理論為基礎，想著在這個充滿怪蟲的絕望的世界究竟還能做什麼，皇子郎終於實行這個已經準備了多年的計畫。
所有的一切，都是為了接任下一個世代的愛歌。
北條皇子郎對怪蟲發動了殲滅計畫。
具體是，用機動魔法兵直接和怪蟲連接在一起，用魔法從怪蟲體內抽出怪蟲病毒，然後封印在東京城地下作出來的小世界。
理論上是懷特也認同的方案，但結果而言，這個計畫失敗了。
由於這樣龐大的魔力暴走，人們的記憶被歪曲了，怪蟲和機動魔法兵的本質發生了變異，在時空歪曲的時候進化之塔出現在皇泉學院的同時，聖蟲和成為機動魔法兵的怪蟲一起被封印在了裡面。
這之後創造出來的，就是這個新世界了。
就結果而言，這個世界取得了和平，但是使用魔法的皇子郎，就像是為了償還歪曲空間的代價，就和看到的1樣，只能自己一個成為停止時空的囚犯了。
另一邊，計畫失敗後的黃泉學院。
經歷了新世界誕生的瞬間的巴御劍和璃貴弗洛斯特·懷特，像大字一樣倒在了學校的中庭，學生們將他們回收後，就在保健室一直睡著。
之後，2個人同時醒過來了。
「早上好。」
「早上好。」
互相打完招呼後，他們就開始調查這個世界到底發生了什麼，然後了解了現狀。
充滿異世界感的騎士和魔法使兩人組成了隊伍，在皇泉學院的食堂如果在我庭院里那樣高興的邊吃拉麵邊討論調查結果。
「出去病毒的理論是完美的。但是到底哪裡出問題了呢…」
托著下巴認真思考的懷特，御劍一臉認真的表情看著他。
「現在的問題是，擺在我們眼前的情況，懷特。」
「世界的在構成嗎。要解除這個的話可相當費工夫啊。」
「就和原來一樣…果然還是必須要把該乾的事做完啊。」
「雖然也擔心不知道去哪裡了的皇子郎和花戀。」
「啊，這個確實很重要…」
御劍放下了拉麵的碗，凝視著自己的雙手。
「還真是構築了一個了不起的世界。我的力量大部分已經流失了。」
「貴公也是嗎，吉魯。雖然我也是。恐怕，在這個世界的物理、魔法法則之中，我等力量的存在本身就是不可能的東西了。被封印住了根源所以完全使不出力。」
就和冷靜的懷特一樣，御劍完全看不出一絲動搖的開始吃剩下的拉麵。
看到這樣的情況，懷特也開始把三明治往胃裡送並說。
「嘛，既然發生了覆蓋法則的非常識的立場，作為超越者的貴公，就算失去力量也沒什麼關係的吧，吉魯？」
「你不是也一樣嗎…就算這樣也沒什麼問題。」
「我等因為是就算世界歪曲時空破碎也有生存可能的超常生命體，所以無所謂，但是這個世界的人到底會怎麼樣呢。」
回答出了這樣不妥當的發言，他們都開始變的認真起來。
「發生這樣亂七八糟的情況，還是先不要刺激這個不安定缺現在還是安定的世界，還真沒想到，這個世界現在處於一個絕妙的平衡狀態呢。這個世界的人還真是幸運。」
「正攻法…嗎。」
御劍和懷特一起向食堂的窗外看去，眺望著在操場的角落矗立著的完全看不到頂的塔。
「就是那個。」
「就是那個了吧。」
到達塔下的兩人，看著這個穿過雲層頂端直到遙遠的太空才看不見的非常識的建築。
「我以前有見過這樣的東西。」
「還真是奇遇啊，我也是。」
推測不出那個像葫蘆一樣的懷特心中到底在想什麼，不過御劍沒法壓抑住內心，臉上露出的難過的神情。
「這裡是吞噬人類生命和心靈的地方。」
這樣發出聲聲嘆息，說了這個禁忌的名字。
「進化之塔…嗎。」
「…喂？在我的故鄉叫法可不一樣。不過也想不出其他什麼好辦法了，基本和你的想法差不多。在古文書里，有記載過這座塔。【會在應該跨越試煉的人面前出現，等待著其到達塔的頂端，是最邪惡也是最神聖的塔】。」
「看來要再上1次這座塔了。」
「這還是不可思議啊。這座塔的攀登資格，應該一個人只有一次的。」
「就是說，這是為了讓我們以外的誰登上去的？」
「這樣的話，到還真是謝天謝地。這塔頂上是時空交錯的地方。一旦離開了這裡，是你的話還可以回來採取些什麼的吧。我們應該好好感謝這個本來要登塔的人。」
「也是啊…」
雖然說著這樣的話，御劍和懷特露出與其說是感謝的表情，不如說是對那個人同情的表情。
向塔頂邁進的第一步，御劍和懷特先是拜訪了老朋友經團新連會長.真田武彥。
之後，偽造了假的戶籍，得到了生活費，並且還嵌入到了皇泉學院里施行工作。
「還真是有一個不錯的朋友呢。」
「是啊，不過不要說著像是敲詐一樣的話呢，懷特君。那傢伙這次這是賣了很大的人情，不過，為了這次的事，以後總有一天要好好回報他。」
得到的假戶籍用的名字是，山風忍和天道鍾。在皇泉學院走廊里大步走走著的兩人輕聲說道。
「不過，真田先生有原來世界的記憶還真是幸運呢。」
「那傢伙，也是本來就要登上塔的像是布和石頭般的存在。但是，為什麼要讓我們來學校啊？」
「由於我們今後都要在塔周圍行動。既然塔是在這個學院的領地內，如果我們是外人的話，現在的情況就是可疑分子了。」
「不虧是大賢者…」
一邊低聲嘟噥著，御劍就像對真田武彥那樣，想了想這可能會是自己之後那個繼續登塔的人所需要的條件。
就這樣開始上學的他們，成立了救世機關探求部，以這個為據點向塔頂進發。