蒙時雍的率眾投降並不代表著吳軍和太平軍的南京大戰畫上句號，為了徹底消滅南京城裡和城外的敵人，吳軍又足足用了兩天多的時間清剿城內殘敵，抓捕隱藏在民間的太平軍將士，追殺逃進北面紫金山區的太平軍官兵——也順便收繳太平軍十餘年來在江南各地搜刮來的金銀珍寶，古董文物，沒收太平天國各大頭目聚斂貪污而來的民脂民膏，黑吃黑吃得不亦樂乎。
一部分太平軍將士的頑固表現讓吳超越和吳軍將士都十分意外，在洪秀全已死、李秀成被俘和蒙時雍已經主動投降的情況下，一部分的太平軍將士不但依然拒絕放下武器投降，堅持依託街巷房屋與吳軍血戰到底，還有人直接喊出了『不留半片破布給妖兵享用』的口號，寧可一把火燒燒掉他們所保護的財產物資，也不願讓吳軍將士的貪慾得逞。期間江浙太平軍的重將吉慶元戰死，李秀成的乾兒子李容發則是不知所蹤，不知道是死在了隨處可見的火海之中，還是藏身進了民間。
許多的吳軍將士因此倒在完全勝利前的最後一刻，許多的太平軍將士在被重重包圍後先是打光子彈，然後縱火自焚而死，而這其中既有被邪教洗腦最嚴重的南京太平軍，也有加入太平天國時間不是很長的江浙太平軍。而更加讓人難以思議的是，在吳軍已經一再承諾不少俘虜的情況下，短短的兩天多時間裡，吳軍戰俘營中竟然先後發生了三起千人規模的戰俘暴動，小規模的騷動逃亡更是多達二十餘次，逼得吳軍將士只能是痛下殺手，殘酷屠殺了近兩千名已經放下武器投降的太平軍士卒。
考慮到將來光復東南的戰事很可能要以懷柔為主，吳超越也十分重視這些情況，花了相當不少的力氣調查太平軍為什麼這麼頑固的原因，還有太平軍戰俘為什麼會在放下武器後再次作亂的原因。結果調查出來的結果讓吳超越感覺棘手，原因一是太平軍的確被邪教洗腦十分嚴重，相信為太平天國戰死後可以上到天堂；二是各種各樣的國讎家恨，許多太平軍將士想為戰死遇害的親人報仇，所以堅持要和吳軍血戰到底。
第三則是流言作祟，太平軍戰俘中不斷有人傳言說吳軍遲早會屠殺戰俘，導致太平軍戰俘為了活命而暴亂逃亡，而這樣傳言的源頭既有些來自被邪教洗腦嚴重的太平軍戰俘，也有很多是太平軍戰俘不肯相信吳軍不殺俘虜的承諾，在恐懼中自行創造的謠言。
「麻煩啊，這些沒腦袋的蠢貨長毛，放下了武器也不讓人省心啊。這些蠢貨怎麼就不想一想，江浙福建還有那麼多土地城池被其他的長毛掌握，老子是瘋還是傻了會去干屠殺戰俘的事？老子以後還想不想招降其他的長毛軍隊了？」
揉著漲疼的太陽穴，吳超越滿嘴髒話，全無咱們大清鎮南王的風度風範，好在在場的幾個吳軍文武都已經熟悉了吳超越的為人德行，對此倒也見怪不怪。點頭附和之餘，戴文節還建議道：「鎮南王，應該早點處理戰俘的事了，一是我們現在需要穩定人心，二是好幾萬的戰俘關在戰俘營里，糧食消耗也是個大問題。」
「鎮南王，按老規矩辦吧。」周文賢也建議道：「老弱的發點乾糧和路費遣散，青壯的甄別收編一部分，剩下的打發到工地礦山干幾年苦役，這樣一來，長毛戰俘的人心也就可以穩定了。」
「當然得儘快這麼干。」吳超越點頭，又皺眉說道：「不過這次有點不同，我想多收編一些長毛的精銳戰兵，把他們武裝起來，用來打剩下的長毛，北方的亂黨，還有我們答應過琉球國要給他們幫忙打扶桑，這些戰俘也正好可以派上用場。」
「這事好辦，青壯的長毛戰俘里，只要把兩廣老賊挑出來，剩下的想怎麼收編都行。」戴文節想不想就說道：「至於那些出了名頑固的兩廣老賊，要不就發配去當苦役，要不就賣到海外去當勞工，既不違背我們的承諾，又可以徹底消弭隱患。」
發配去做苦役和賣到海外做華工，一向都是吳軍對待太平軍兩廣老兵的不二法門，已經無比清楚太平軍老兵頑固程度的吳超越當然再次點頭，然而吳超越的神情依然還有些擔憂，盤算了半晌後，吳超越還突然說道：「我想重用李秀成，讓他重新帶著這些新收編的戰俘上陣作戰，幫我們去打剩下的長毛，北方的亂黨，還有海外的日本鬼子，你們覺得怎麼樣？」
「這……，太冒險了吧？」戴文節、張德堅和周文賢等人一起驚呼，都說道：「鎮南王，這是不是太弄險了？李秀成這個大長毛是被我們包圍後被迫投降，又在長毛軍隊里威望那麼高，讓他去統率新收編的長毛降兵繼續上陣作戰，不是等於放虎歸山，給他東山再起的機會？他只要稍有異心，我們之前在江寧戰場上的努力，馬上就要白白浪費啊？」
「但如果李秀成能夠死心塌地的為我所用，那我們不但馬上可以增添一支精銳勁旅，接下來的東南大戰，也可以輕鬆許多。」吳超越淡淡說道：「收復江浙福建的失地，我們起碼可以少打上百場仗，節約至少一年的時間，少犧牲無數的將士。」
「話雖不錯，但我們如何能夠確認李秀成死心塌地的為我們所用？」戴文節問道：「如果李秀成心存異志，大可以假裝向我們投降，先騙到兵權恢複自由身，然後不但可以隨時帶著軍隊逃回江浙，說不定還會在背後突然捅我們一刀，給他效忠的洪秀全報仇。」
吳超越不說話了，因為這也是吳超越現在最擔心的一點，又盤算了許久後，吳超越才問道：「李秀成的家人現在怎麼樣了？」
「都很好，按鎮南王你的吩咐，抓到的李秀成家人都一律善待，暫時關在了我們的雨花台營地里。」周文賢答道：「李秀成的老娘在被抓前想要懸樑自盡，也被我們救了下來，專門安排了一個郎中看護。」
「安排人手，把她們送去和李秀成團聚。」吳超越吩咐道：「明天中午的時候，帶李秀成來和我一起吃頓午飯，我想見見他，摸清楚他的想法，然後再做決定。」
周文賢唱諾，又小心提醒道：「鎮南王，千萬要防著李秀成表裡不一，騙你信任。」
「那是當然。」吳超越搓動著瘦長手指說道：「對於李秀成，我是很想重用，但我絕不會冒險，不會讓我們將士的血白流。」
……
能夠橫掃江浙最遠時帶著軍隊打進廣東，李秀成當然不是什麼善於之輩，事實上吳軍將士剛把李秀成的家人送到李秀成的身邊，讓李秀成一家團聚時，李秀成驚訝於吳超越善待自己家人的舉動之餘，也很快就明白吳超越是在向自己示好，想利用自己的身份和威望招降江浙蘇杭的太平軍，為此也多少有些猶豫，不知道自己是應該投降保命，還是繼續為太平天國堅貞不屈，寧死不做叛徒？
然後很自然的，這些年已經讀了不少書的李秀成很快就動了效仿家門李自成先降後叛的念頭，並且一度幻想如何逃出牢籠，到江浙後方去東山再起，為洪秀全和太平天國報仇雪恨。——這也是人之常情，還真怪不得李秀成。
而再接著，第二天上午，當吳超越派人來邀請李秀成與自己共進午飯時，李秀成馬上就明白吳超越要來真格的了，雖然還沒有做出任何的決定，但是看在吳超越善待自己年邁老母和妻子孩子的份上，李秀成也沒有昂著頭斷然拒絕吳超越的好心邀請，稍做盤算就隨著吳軍將士來到了吳軍的中軍營地，生平第一次見到了傳說中的吳超越，也終於親眼驗證了一條傳言的真假——和口頭相傳的一樣，吳超越確實長得又干又瘦，容貌平平不怎麼好看。
讓李秀成意外的是，同樣是第一次見到自己的吳超越竟然正在會見一些特殊的客人——幾個南京附近的普通百姓，有屬於鄉紳階層的小地主，也有種田耕地的普通百姓，有普通商人，也有工匠手藝人，還有趕車賣苦力的城市貧民。而在與李秀成見面之後，吳超越也沒有急著和李秀成說話，主要就是與這幾個普通百姓交談，向他們打聽生活情況，還有戰亂帶給他們的影響。
不知道吳軍將士帶來的李秀成就是太平天國的二號人物，幾個受寵若驚的普通百姓都是有問必答，一個勁的只是向吳超越哭訴太平軍強加給他們的種種苦難，苛捐雜稅、過份勞役、強行徵兵、殘酷刑法、濫殺無辜和踐踏風俗等等暴行不一而足，也坦言承認太平軍的殘暴統治與貪官橫行的滿清朝廷一般無二，甚至還有很多地方有過之而不及。吳超越聽了不斷嘆息，又突然宣布對飽受戰亂之苦的江寧府免稅兩年，換來了幾個百姓的感激涕零，磕頭道謝。
還是在讓親兵領著幾個百姓下去用飯之後，吳超越才轉向了李秀成，先是和李秀成客套了一番，吩咐人上酒上菜，邀請李秀成入席，又突然對李秀成說道：「聽說你治下的江浙情況要好一些，不過有些地方又聽說比江寧這邊更嚴重，在浙江的諸暨縣，你的直屬部下余天安李飛為了徵稅徵兵，還直接逼反了諸暨的老百姓，逼得他們在諸暨的包村聚眾起義，你的部將周文嘉為了平叛，包圍包村切斷水源，連渴死帶屠殺，一口氣殺了好幾萬的普通老百姓。」
「鎮南王的意思是，想殺了罪人，為包村的百姓報仇？」李秀成警