其實那怕到了吳軍僥倖炸開神策門東段的城牆時，太平軍都仍然還有希望守住南京城，因為就在這不久之前，李秀成的乾兒子李容發剛派人給城上送去了一批火油和火藥，倘若城上守軍反應快腦袋靈活，趕緊把火藥和火油砸進缺口裡點燃，擋住吳軍進攻絕對不是沒有機會，乘機堵住缺口也絕不是痴人說夢。
城牆上的太平軍中的確有頭腦靈活者，才剛從城牆倒塌後的慌亂震驚中回過神來，馬上就大吼大叫著要求同伴趕緊砸火藥桶潑火油，然而很可惜，場面太混亂了，幾個清醒者的瘋狂叫喊並沒有被多少同伴聽到，從柳巷送火藥火油上城的李容發軍士卒又被混亂的人群擋住了道路，沒能在第一時間把火藥和火油送到缺口處，結果就錯過了這個寶貴機會。
太平軍錯失機會，吳軍老將胡懷昭親自率領的直屬精銳營卻牢牢抓住了戰機，乘著城牆突然倒塌造成太平軍嚴重混亂的機會，胡懷昭的直屬營從缺口直接衝鋒入城，太平軍士卒雖有反擊阻攔也沒能擋住吳軍將士的腳步，而衝進城中之後，準備充足的胡懷昭直屬營連眼皮都不眨之下，稍微看清楚敵人所在的方向就是接連投擲苦味酸手雷，把企圖上來攔截的太平軍人群炸得是鬼哭狼嚎，死傷連連，同時迅速向城內推進，不計死傷的與太平軍爭奪城內陣地，就象一根鐵釘一樣，牢牢的扎進了南京城內部！
與此同時，此前被烈火攔住腳步的胡懷昭軍周安宇部也飛快退出了瓮城，東進到了距離不遠的城牆缺口處衝鋒入城，而太平軍雖然已經逐漸了恢複一定秩序，開始向著城牆缺口處投擲火藥火油，給吳軍造成了不少的傷亡，可周安宇所部營隊仍然還是冒煙突火，前仆後繼，接連沖入城內，補強吳軍的城內兵力，也幫著胡懷昭成功的拿下了一片不算小的城內陣地空間。
「上！上！衝上去，把妖兵趕出城！把妖兵全部趕出城！」
急紅了眼睛的李容發等太平軍將領瘋狂吼叫，逼著太平軍士卒反衝鋒上前，同樣知道情況危急的太平軍將士也個個奮勇，人人爭先，潮水一般的湧向吳軍陣地。可是沒辦法，吳軍精銳營的武器裝備優勢實在太大了，面對著太平軍將士的瘋狂反撲，吳軍胡懷昭和周安宇兩個精銳營的將士沉著迎戰，先是以擊針槍快速射擊對面之敵，盡最大可能在遠程戰中殺死殺傷敵人，接著又用苦味酸手雷攻擊逼近之敵，同時一些動作靈活的吳軍將士還直接打出擲彈筒，槍聲炮聲接連炸響間，太平軍士卒就象割麥子一樣的接連倒地，幾乎沒有任何機會集群逼近吳軍陣地，偶有幾個漏網之魚僥倖靠近，也被吳軍基層將領用左輪槍打翻，讓太平軍就是連想靠近吳軍打白刃戰都是難如登天。所以太平軍的反撲攻勢雖然猛烈，卻始終收效不大，相反還被吳軍的擊針槍打得死傷不斷，又被手雷擲彈筒炸得屍橫滿地，再怎麼勇猛衝鋒都是基本徒勞，相反還付出了十分慘重的傷亡代價。
在此期間，早就已經親自率軍來到了神策門外的吳超越始終按兵不動，一直沒有急著再向城內投入兵力，因為吳超越不知道胡懷昭已經拿下了多少陣地空間，擔心過早投入兵力會造成人群擁擠，收到適得其反的效果，同時吳超越也信得過自軍精銳營的戰鬥力，相信胡懷昭一定能守得住缺口道路。所以吳超越一直都表現得十分耐心，還是在此前登城成功的吳軍營隊求援後，吳超越才不緊不慢的派出了一個普通營，攜帶飛梯上前，增援同樣重要的城頭陣地。
老將胡懷昭沒讓吳超越失望，在他的沉著指揮下，八百多名首先殺入城內的吳軍將士就象中流砥柱一樣，牢牢的釘在了城牆缺口處，打退了太平軍一波接一波的衝鋒，守住陣地大量殲敵的同時，還偶爾能騰出手來增援西面的城上戰場，幫著此前奇蹟般登城成功的常亮營隊對付城上殘敵，也讓常亮營隊可以稍微騰出手來，接應援軍用飛梯登城，打得沉著勇敢，有條不紊，盡顯強軍風範。
終於，經過半個多小時的苦戰後，第二個營的吳軍終於蟻附上城，與此前上城的常亮所部聯手驅逐了神策門城上的太平軍殘敵，拿下了已經被燒成一片灰燼的城樓陣地，將張牙舞爪的吳軍大旗插上了吳超越曾經親手保衛過的神策門城頭！結果在望遠鏡中看到了這一情況後，李容發和方海宗等太平軍將領也紛紛陷入了絕望，都在心中慘叫道：「完了！神策門不可能守得住了！」
神策門是無論如何都守不住了，拿下城樓陣地後，吳軍不僅有了居高臨下的優勢，還徹底粉碎了太平軍重新堵上缺口的希望——缺口另一端的城牆頂端已經被吳軍控制，太平軍當然不可能再用土石沙包堵住缺口。所以吳軍再次派軍上城，徹底拿下神策門的控制權，實際上也就只剩下了時間問題。再所以李容發等太平軍將領也沒有了多餘選擇，除了絕望的逼迫軍隊繼續上前爭取創造奇蹟外，就只能是趕緊派人和李秀成聯繫，請求李秀成指示下一步的作戰計畫，是繼續打巷戰，負隅頑抗到底？還是趕緊棄城突圍，爭取逃命希望？
凌晨一點零八分，李容發的戰情報告和請示要求最先送到李秀成的面前，李秀成鐵青著臉盤算了大約半分鐘，然後才聲音嘶啞的吼道：「告訴李容發，死戰到底，沒有命令，不許後退一步！袁得厚、方海宗和陳得才那邊，也是一樣！」
言罷，李秀成又轉向了旁邊的李書香，語氣嚴肅的說道：「書香，接下來的全城指揮暫時交給你，記住，不管妖兵玩什麼花樣，對我們每一支軍隊的要求都是就地死守！絕不許後退半步！」
「忠王，你要去見天王萬歲？」
李書香猜到了李秀成暫時離開指揮部的原因，李秀成坦然點頭，沉聲說道：「如果我所料不差的話，妖兵即便拿下了神策門，也絕不會急著向城內推進。所以現在突圍突圍，我們還有希望，我去盡我的努力勸說天王萬歲棄城，事情到了這步，我就不信天王萬歲還會執迷不悟下去。」
李書香不再多問，只是點頭囑咐了一句讓李秀成小心，一直等在旁邊的李秀成大舅子宋永琪則乘機跳了出來，說道：「忠王千歲，我留在這裡沒什麼用，我和你一起去吧，在路上給你打點下手什麼的。」
沒心思搭理大舅子，李秀成只是隨意點了點頭，宋永琪大喜，趕緊跟著李秀成一起出了忠王府大殿。結果到了準備上馬出門的時候，早就沒安什麼好心的宋永琪也就有了機會，低聲對李秀成說道：「忠王千歲，城破在即，你難道還不想為大嬸和我那可憐的外甥考慮一下將來？」
「都什麼時候了，我沒那個心思。」李秀成不耐煩的答道：「而且現在我也沒辦法為她們考慮將來了！」
「忠王，你有辦法。」宋永琪也沒客氣，低聲說道：「現在城裡的軍隊，大部分都聽你的指揮，你如果振臂一呼，帶著軍隊把天王萬歲拿下，把他獻到鎮南王的面前……。」
「啪！」
一記沉重的耳光打斷了宋永琪的慫恿蠱惑，不肯解氣，李秀成又提起了自己的馬鞭，劈頭蓋臉的對著宋永琪抽了一頓，然後才怒吼道：「宋永琪，你把老子當什麼人了？你如果不是老子的大舅子，老子現在就宰了你！」
「以文，你別生氣。」宋永琪沒什麼懼怕神色，還叫了一聲李秀成的小名，摸著被李秀成抽腫的臉說道：「正因為我是你的大舅子，所以我才得為考慮。一邊是光輝前程，榮華富貴，一邊是萬丈深淵，死無葬身之地，以文你該早下決斷了。」
宋永琪說這段話的時候，也不知道是什麼原因，李秀成腦海中居然突然閃過了吳超越寫給自己的那封招降信。但是很可惜，吳超越的難看筆跡僅僅只是在李秀成腦海中一閃而過，並沒有帶起任何的浪花，李秀成只是頓了一頓，然後一腳就把宋永琪踹翻在了地上，吼道：「滾回去！等老子回來發落你！」
踹翻了宋永琪後，李秀成騎上親兵送來的戰馬揚長而去了，再沒有搭理宋永琪一句，宋永琪則慢慢的自己爬了起來坐在地上，看著李秀成離去的方向，臉上還儘是奸笑，喃喃道：「以文，你沒殺我，就證明你還是有這個念頭。快下決心吧，我的榮華富貴，嬌妻美妾，就全看你了。」
不說宋永琪的白日夢，單說李秀成領著一隊親兵在依稀可聞的槍炮聲中打馬急行，來到了以前的兩江總督府現在的天王府所在的西華門大街後，馬上就毫不意外的發現，天王府這邊早就已經是三步一崗，五步一哨，街道上擠滿了裝備精良的太平軍將士，也全都是洪秀全兩大親信寵臣蒙時雍和秦日綱的隊伍。而進街之後，這些軍隊不但要求李秀成的親兵全部解除武裝，還要李秀成本人也交出武器。
沒什麼心思去計較這些小事，李秀成很痛快的就把佩劍和手槍交給了秦日綱部下，然後才到天王府門前請求覲見。結果也還好，很快就有女官出來請李秀成入內，然而讓李秀成詫異萬分的是，當他來到金龍殿前時，金龍殿外居然按跪著三個太平天國的文武官員，再仔細一看他們的相貌時，李秀成頓時就驚叫出聲，「洪仁玕？曾立昌？你們犯什麼事了？為什麼被拿下？」
被按跪在金龍殿外的三個太平軍文武