那年秋天，許多人瞄過華萊士寫於沙撈越、在倫敦發表的文章，但多數讀者僅是輕率地略過。文章中寫道：「加拉巴哥群島上有為數不多、但僅見於該地的奇特動植物，而其中絕大多數在南美洲可以找到血緣相近的物種。這種清楚展現在眼前的現象，迄今連推測性的說明也沒有。」這是一種較客氣的說法，指明了因記述加拉巴哥群島上的動植物區系而走紅的達爾文，顯然沒能領略其中的重要性。
一八五五年那個時候，達爾文主要還是以記述小獵犬號探險時所寫成的《研究日誌》（Journal of Researches）而聞名。這本書雖然有個粗俗的全銜，但卻是一本很棒的遊記。在小獵犬號五年的航程中，逗留在加拉巴哥群島的時間不過是一個小逗點，但達爾文曼妙的文筆卻把這些島寫得活靈活現的，成為日誌中最膾炙人口的精華之一。
除了生動的記錄外，達爾文從加拉巴哥群島帶回來的大量樣品，例如鳥的皮膚、浸泡在防腐液中的爬蟲、昆蟲和多種植物，讓各路專家好漢繼續忙了好幾年。
一八四五年，日誌的平價修訂版發行，內容根據那段時間內，專家學者對達爾文攜回樣品的研究結果，而增加些許加拉巴哥群島上動物區系的描述，達爾文寫道：「這些島嶼的自然歷史著實奇特，值得好好注意。群島上大多數生命都是造物者在本地絕無僅有的怪異之作，有時甚至連各島的棲息者也有所不同。然而這些造物者的怪異之作，雖然和美洲隔著五、六百英哩寬的海洋，卻都跟美洲當地物種有相當密切的關係。」達爾文讚揚這個群島是自成天地的小世界，他小心翼翼地暗示在這個小世界中，「我們似乎被帶到一個偉大事實的邊緣，一個萬秘之謎——第一個新物種在地球上出現的方式。」
多數的生物學家會把眼光放在眼前的一塊草皮上，但達爾文卻放在遙遠的加拉巴哥群島。可惜他對島上生物所蘊含的意義，只提出有限又隱諱的註解。所以，當他讀到華萊士對於加拉巴哥現象所發表的看法：「迄今連推測性的說明也沒有」，想必是心有戚戚焉，說得實在是一針見血啊！
誰能解開萬秘之謎？
二十年過去了，達爾文仍然沒有闡明如何解開「萬秘之謎」。他的演化論巨著還懸在半空中。那時，華萊士這個馬來甲蟲的蒐集者兼販售者，這個自學出身、從未在劍橋或牛津上過一學期課的無名小子，鹵莽且具威脅性地要自個兒找出答案。
「加拉巴哥群島是一高齡火山群，」雖然未曾親眼目睹，華萊士如此寫道：「往昔它們也像現在一樣，沒有跟大陸相連過。」維多莉亞時代許多有學問的人，曾唸過達爾文的日誌，但鮮少如華萊士一般，對加拉巴哥一章如此精讀。華萊士在沙撈越一文中繼續寫道：「相信如同其他新生島嶼一般，藉由風和浪潮的作用，加拉巴哥群島有了第一批進駐者。隔離一段夠長的時間後，原有遷徙而來的種類都已逐漸死絕，只有一些經改變的原始型（modified prototype）存活下來。」
這些所謂經改變的原始型就是達爾文曾經報告過的特有物種，例如龜、雀（finche）、嘲鶇（mockingbird）、鬣蜥（iguana）等。其中島上一票近親種類的雀，更是華萊士法則的最佳代言。華萊士正引用達爾文的資料，大膽提出達爾文自己不敢提的觀念：「在演化的自然過程中，隔絕和時間的加乘作用下，新的物種應運而生。」華萊士沒有進一步說明是什麼力量讓這個過程進行，但沙撈越一文清楚地宣稱他正致力於這方面的研究。
大約在這個時候，華萊士和達爾文之間開始通信。
華萊士寫的首封信函中，希望雙方能就他隱含在論文中那個異想天開的觀念，展開長距離的對話。儘管他是個羞怯的年輕人，但還不至於羞赧到不敢向名人求教。
第一封信石沉大海，達爾文收到了，但沒有留下。目前我們僅知那封信的發信日期是一八五六年十月十日，發信地為西里伯斯島，當時的華萊士正落腳於此。
七個月後，達爾文總算回信了：「從你梢來的信和一年多前發表於年報的文章中，我清楚地看到我們有極相近的想法，並且在某種程度上趨向一個相似的結論。」達爾文還表示，事實上兩個科學家對一個定律有如此一致的看法，是很不尋常的。
顯然，達爾文那時已更仔細重讀過華萊士的文章，他不再誤以為那只是神創說意見的翻版。事實上華萊士所領略的，已直逼萬秘之謎——這下子可讓達爾文憂心極了！
在一段聽起來有點妒忌味，又有點自憐自艾的信中，達爾文這樣告訴華萊士：「自從我開始用第一本筆記記下關於物種和其變種是如何、又以什麼方式讓彼此間有所不同，到今夏已將滿二十年。現在我正準備將它出版，但我發現這個題目實在很鉅大。雖然我已經完成很多章節，但恐怕在兩年內還無法全部完成並付梓。」這段話和緩地主張他對某一觀念擁有所有權，卻又不言明葫蘆裡賣的到底是什麼膏藥。好像在暗示：只要你稍微有點耐心，不久後我就會解開那困擾我們兩人的科學之謎。
在兩段文字之後，達爾文又在信中寫道：
「由於篇幅所限，我確實『不可能』在信中闡明我對『在自然狀態下，物種變異的進行方式和原因』這個問題的看法，但我已經慢慢釐清一個清晰而具體的觀念。至於是否正確，他人自有公論。」
就達爾文來說，它可能清晰而具體，但在達爾文紆尊降貴揭去它的面紗前，不論是達爾文、華萊士或者是其他人，都無法評論它究竟是對或錯。
如果達爾文無心和人分享他的見地，最後又何必回信給華萊士？噢，也許因為達爾文是個翩翩君子，不厭於書信往返，只要收到科學同好來函，即使是籍籍無名的後輩小子，習慣上都會予以回覆？
其實，書信的背後是另有用心的。達爾文寫道：「我不知道你打算在馬來群島停留多久。毫無疑問的，你此行會有相當豐碩的收穫。我企盼在我的著作問世之前，能由你在遊歷中所完成的著述中得到一些裨益。」如果此時華萊士自忖，自己的著作還需要若干年才能付梓，那麼他就可能會提供達爾文一些資料，這時達爾文最感興趣的，華萊士認為應該是物種在海洋性島嶼上的分佈。