王宗超在生化世界時，用了剩下五個月時間協助艾麗絲等人搗毀保護傘的各處據點以及與保護傘有著種種聯繫的，散布生化病毒進行恐怖活動的恐怖組織。由於艾麗絲已經修鍊了種種精神力技能，幾乎可以直接在對方的大腦內獲得情報，在南極基地又複製了更多克隆體又保證了獲得情報過程的高效率。在她絕對的情報優勢與克隆體的人數優勢，加上王宗超所向披靡的絕對的武力優勢配合下，幾乎可以說是摧枯拉朽地把保護傘所有明暗勢力都連根拔起。
不過為了避免過度刺激保護傘令其狗急跳牆，他們同時還藉助阿萊西亞兄妹的名義行動。由於這兩兄妹的祖父愛德華·亞西福特是保護傘的創立者以及T病毒奠基者之一，一直廣受保護傘研究員所敬仰。所以藉助亞西福特家族的名義可以讓保護傘中、下層人員感覺到這只是一場高層權力變動以及保護傘的重組，不會觸犯他們的切身利益。就像威廉當初懷疑王宗超是阿萊西亞研製出的生化武器，其他研究員也有理由相信這位天才少女在潛匿了十五年之後又有了劃時代的驚人研究成果，並正借超級生物兵器重新確立自己家族對保護傘的控制地位。就這樣，王宗超與艾麗絲控制住了大半保護傘秘密基地。
但在這個過程中，保護傘的實際掌控者，陰謀家斯賓塞卻是非殺不可。王宗超與艾麗絲用了整整三個多月追蹤，最終才在一個保護傘地下基地把這傢伙逼上絕路。只是臨死前他竟然引爆了一個一千萬噸級的氫彈，與入侵者來了一個同歸於盡。
不過好在王宗超對這點早有防備，他讓艾麗絲始終只乘坐一輛直升機在十里外的高空遙控二十幾名克隆體深入地下作戰。同時自己始終步步為營，留好後路，確保無論遇到任何危及情況都能及時遁逃。在核爆前幾秒憑著三階基因鎖頂峰，開始感悟末那識後神而明之的危機感應，瞬間逃出地下基地並飆出半里之外。在他狀態完好的情況下，雖然毀損範圍極廣的巨大熾熱火團還是將他捲入其中，但畢竟沒法重創他了。
而艾麗絲則損失了二十幾名克隆體，自己卻及時駕機飛出了核爆範圍，雖然飛機在隨之而來的衝擊波與核電磁脈衝下墜落，不過她在自己的念動力護持下，還是依然無損。
事實上，正如王宗超對何師祖剛剛生出敵意，還未準備有所行動，對方已經有所察覺一樣。基因鎖三階高手的危機預知近乎未卜先知之術。針對他的陰謀活動越是多人參與，越是目標明確，越是謀劃精巧滿有成功把握，越是殺意、敵意強烈，就越是能夠讓他生出感應從而先行趨避。而如果是臨時起意的陰謀計算，卻又難以做到精巧必殺。如果斯賓塞準備的核彈是好幾個千萬噸級的，強烈的危機感甚至會讓王宗超根本不會前往。所以基因鎖三階高手除了精神力者外，實際戰力雖然不見得比二階頂峰高出多少，但卻比二階頂峰高手十倍難殺！
但即使是這樣，三階高手也切忌弄得舉世皆敵，如果每時每刻都至少有上百個人在計算謀劃你或者在痛打紮成你模樣的小人，大量的敵意怨氣必然會將原本清明的感知攪成一攤渾水。即使對方不清楚你的姓名與具體形象，但冤有頭債有主，怨氣敵意在冥冥中也會有所針對。或者三階高手將大量心力集中在某件事物上，對於危機感知也會有所減弱。何師祖當年結下大量因果孽報，又一心煉製殭屍王，兩個禁忌全犯，這才造成機會讓王宗超等人得手。
而那次也是王宗超與艾麗絲遇上的最兇險一次危機，此外基本上都行事順利。只是T病毒依然在全球迅速蔓延開了，這種病毒絕對是窮人的核彈，屬於吐一口痰毀滅一個城市那種。即使保護傘不用，也有許多極端主義組織或個人樂意去使用。潘多拉之盒已經打開，就不是單純毀滅或者控制了保護傘能夠關上了。不過好在三種克制T病毒的藥草已經廣泛散布出去，雖然目前基於這些藥草研製的T病毒消毒液以及疫苗還談不上完善，卻也一定程度減緩了T病毒蔓延速度，並讓感染者有了百分之十左右痊癒的可能。
不過在人類逐步在對抗T病毒鬥爭中穩住陣腳時，T病毒也在核輻射下變異發展出種種變體，大量動植物在T病毒與核輻射雙重作用下也大量死亡，餘下也發生了一系列可怕的變異。僥倖存活的生命，卻又要時刻面對其他兇猛變異生物的捕食。而大型變異獸還罷了，攜帶T病毒的小型昆蟲、老鼠更是肆意傳播病毒，大自然的食物鏈面臨崩潰的邊緣。
針對這種情況，各國政府不得不投入大量資源在海上、地下或者冰原、高原上建造了一些全封閉式避難所，幾乎可以說杜絕任何昆蟲、飛鳥的進入，確保避難所中的人不會受到病毒威脅。
然而即使是政府，也只能保證少數一部分人的安全。而在末日危機驅使下，人性的種種醜惡之處一展無遺，許多人瘋狂地收集各種武器與生存資源，不惜燒殺搶掠，社會陷於無政府的混亂狀態。由於能夠進入避難所的只有佔據很少比例的一部分人，在此過程難免造成許多不公。許多被拒之門外或者有親屬由於被拒之門外而喪生的人對於避難所內的人們無比嫉妒憎恨，甚至千方百計要把病毒散布進去……
人類在和病毒作鬥爭，同時也在與自己丑惡的一面作鬥爭。末世危機雖然在王宗超與艾麗絲等人努力下得以延緩，但還遠遠稱不上解除。
所以艾麗絲如今的處境依然艱難，肩頭擔子很重，但相比起電影中已經好了許多倍。王宗超也清楚這點，不過他既然盡了人事，也就不會無謂地一直將此事放在心頭牽腸掛肚，而是抓緊時間消化在生化世界的收穫，修鍊武道。
在生化世界的收穫，除了領悟四階的一些奧秘之外，最重要的突破就是將冰火內力修鍊成「純火」狀態，只要再練成「純冰」狀態，冰火六重天即可大功告成。而另外一個收穫，就是在兩次對抗核彈的過程中，結合高科技超武的基本資料，對高科技超武的入門已有了相當的體會。
高科技超武在能夠以人體發揮小型核武器級威力的同時，也意味著要求人體能夠承受住核武器爆心威力。所以強大且特殊的肉體依然是其武學根基，其中一個最重要的是修鍊成「鈾晶戰體」。
『鈾晶戰體』的高明之處，不在於一味令肉體強大到足以硬抗核爆，而是能夠在核爆的一瞬間，將自己的身體轉化為比金剛石還要堅固的透明晶體構造，令光輻射、伽馬射線、中子流、核電磁脈衝等全部毫無阻礙地透體而過，不損自身，而自己所需要承受的只是核爆衝擊波造成的物理傷害罷了。
這就像上萬米深海的水壓足以把鋼製的坦克壓扁，但卻還有許多深海魚可以生存，那不是因為魚的身體比坦克更強，而是因為魚皮組織僅僅是一層非常薄的層膜，讓水壓完全滲透過去，內外壓抵消，自身並不受力。
王宗超此時正盤坐在高科技訓練場中構造出來的一個封閉空間中，四周牆壁與天花板、地板全部都是鏡子的結構，整個空間中的光線雖然不亮，卻瀰漫著一種綠瑩瑩的光芒。
這種光芒是一種極為強烈的輻射，如果是普通人暴露在這種環境中，即使只呆了1秒也會在之後患白血病而死，不過這顯然還不足以威脅王宗超。他還從空間袋中取出一劑針管，將其中的某種藥劑注射入自己體內。
這劑針管正是在生化世界中被稱為「侵犯神之領域的極惡物質」——G病毒！注射過後，王宗超全身皮膚下的經脈血管如同被注入空氣一樣腫脹起來，就像一條條噁心的蚯蚓一樣開始出現異常的蠕動與伸縮，似乎要開始破體而出，皮膚上也開始長出了一連串的水皰，慘不忍睹，不知是因為強輻射還是因為病毒作用。
雖然面露痛苦，但王宗超依然端坐如故，那些水皰不久之後開始破裂，流出了腥臭異常的黑色膿水，隨後王宗超身上的異變也漸漸得到緩解。而這些黑色膿體還如同有生命般在王宗超體錶快速流動著想鑽回他體內，但卻被他的護體真氣完全隔絕開來。
這些正是G病毒入侵以及輻射影響後失控的異化細胞，但都被王宗超入細入微毫無疏漏地驅出體外，而剩下地，就只有有利於他的基因變異。
不久之後，只見王宗超的皮膚變得晶瑩剔透，隱現其中的血脈、肌肉、骨骼組織，觸目驚心！
輻射越來越強，瑩光也越來越亮，而王宗超全身的透明之感也越來越明顯，漸漸的整個人已經隱沒在一片耀眼瑩光之中……
許久之後，瑩光消失，王宗超緩緩站了起來，他身上還有許多水皰破裂後留下的醜陋疤痕，人也似乎一下子瘦了十多公斤，但雙目卻迥然有神。
房間中間的地面開始升起一截合抱大的粗大金屬柱，王宗超面對著金屬柱，舉起了右拳，拳頭裡面的血管和肌肉在突然間變得宛若透明清晰可見，就像黑暗中的軸晶石一般，瑩光開始透出，緊接著他一拳落在金屬柱上。
這一拳力道不大，只在金屬柱上留下一個不深的拳印，還不如鄭吒運上血能的一擊許多。但整個柱體內部卻隱隱傳來陣陣爆裂崩碎之聲，許多密如蛛絲的裂痕從內而外瀰漫開來，遍布柱體