九江大敗之後，鄭森屬下三萬大軍被劉能設計擊潰，鄭森部下盡失，心知便是回到堵胤錫軍中再也沒有任何前途。一個失去嫡系部下的將領，等待他的只有朝廷問罪罷了。
所以，他便果斷的帶著陳輝和僅剩的二十多個心腹逃離了九江，然後輾轉逃回了福建。
鄭家發跡於海上，福建才是自己的老巢，鄭森深知，自己要想重振鄭家，只能回到福建，回到泉州。
然而此時的泉州，鄭家的勢力已經被叛軍和王寅水師一掃而空。安平被攻陷，鄭家這麼多年積攢的財富悉數落入叛軍之手。而叔父鄭芝豹等家人雖然逃到了海上，卻被王寅勸降施琅梁立等將，奪去了金廈，鄭家海上的力量悉數落入王寅之手。
所以，即便回到了福建，鄭森震驚的發現，自己想要復起也是幾無可能。
王寅坐鎮泉州，正在進行改編原本的鄭家軍，海上有著強大的明軍水師威懾，哪裡有人肯選擇跟隨鄭森？
然而就在鄭森絕望之時，王寅竟然奉命帶著主力船隊北上，前往杭州參加對叛軍的圍剿，便給了鄭森一個千載難逢的機會。
這些時日以來，叛軍的底細漸漸流傳了開來，在福建，有著為數眾多的被叛軍破家的豪紳士族。這些人一開始還想著朝廷能給他們做主。誰知道王寅帶兵收復了福州泉州，卻絲毫不提歸還豪紳們的家產。再聯想叛軍和陳越王寅之間的關係，福建各地的豪紳頓時絕望了起來。
於是，鄭森便趁機派人勸說，輕易便勸動了一些人。豪紳們原本就和鄭家有著千絲萬縷的聯繫，鄭家獨霸福建十多年，暗地裡積攢的力量依然十分強大。
鄭芝龍死了，鄭芝豹等一干鄭家核心被抓，但是鄭家乃是泉州大族，旁系子弟為數眾多。而現在鄭森是鄭家名正言順的繼承人，故鄭森露面之後，便很快得到了眾多鄭家子弟以及和鄭家關係密切的家族的支持。
掌握了一定的力量之後，鄭森突然發難，在被勸降的千戶甘輝幫助下，攻下了和漳州相鄰的南澳島。之所以現在南澳發難，因為王寅雖走，卻留下了一定的力量監控金廈泉州，再加上背叛鄭家的施琅、梁立等將都登上高位，嚴密監視著鄭家的勢力，鄭森不敢冒險在泉州一帶舉事。
南澳島足足有一百多平方公里，島上百姓數萬，聞聽鄭森舉事，滿腹委屈的豪紳們紛紛來投，很快便召集了五千多軍隊，戰船百多艘。
被任命為漳州總兵的梁立得知鄭森舉事，忙帶著手下軍隊前來圍剿。卻在東山島洋面，被鄭森指揮船隊打的大敗。
梁立的手下多是鄭家軍出身，很多軍官跟隨鄭芝龍當過海盜，根本不肯和鄭家少主作戰。臨戰畏縮不前，士兵不賣力，自然不是同仇敵愾的鄭森手下對手。
眼看大敗，梁立連忙乘船逃跑，卻被鄭森船隻趕上，用飛爪把兩船固定在了一起。一番接舷戰之後，梁立手下大半投降，梁立也被生擒活捉！
南澳島鄭森大勝，潮州漳州一帶的海上豪傑們紛紛來投，連同俘虜的梁立部下，鄭森的兵力很快發展到了一萬餘人。
鄭森雖斬殺梁立祭旗，帶著軍隊攻打漳州府。漳州總兵梁立被殺，漳州境內再也沒有和鄭森匹敵的力量，鄭森率軍輕易攻入了漳州。
鄭森叛亂的消息很快傳到了福州，王寅北上，留在福建坐鎮的最高官員是呂泰，以福建總兵的名義掌管整個福建的軍隊。
然而王寅帶著主力北上，呂泰手中真正的嫡系軍隊只有一萬來人，剩下便是施琅等降兵了。聞聽鄭森作亂攻陷漳州，呂泰不敢怠慢，派人給在延平府的副將送信，命其帶著三千軍隊從延平府南下，從陸路攻向漳州。同時呂泰給泉州的施琅傳令，命其小心戒備，防止鄭森叛軍從海上進攻泉州。
呂泰雖然只派出三千軍隊，然而這三千人都是精銳之師，陸上作戰根本不懼叛軍。
聞聽明軍從北面陸上攻來，鄭森絲毫不做戀戰，下令在漳州搶劫了一番，帶著搶的糧食財物，乘船撤離了漳州府城，只把一座空城留給了明軍。
有了搶奪的大量物質，鄭森的實力擴展的很快。他原本想著回南澳島修整一番，趁機整編一下軍隊，投奔他的漳州童生陳永華獻策，說這個時候不該回師南澳，而是應該一鼓作氣攻下金廈。
陳永華是漳州龍溪人，其父陳鼎乃是舉人。在叛軍攻佔福建之時，陳家也沒有逃過叛軍這一劫，陳鼎帶著家人反抗之時，被叛軍殺死。故陳永華對叛軍以及叛軍背後之人恨之入骨。鄭芝龍率軍攻入了漳州，年僅十五歲的陳永華主動投到鄭森軍中。陳永華雖然年幼，卻已經通過縣試府試，只要再通過院試便可獲得秀才功名，人雖然年少，卻少年老成很有才華。
「少將軍，督師王寅帶著主力水師北上，現在福建兵力空虛至極，正是經略金廈的好時候。少將軍您是南安侯嫡子，金門廈門又是鄭家的老家，南安侯的嫡繫心腹為數眾多。只要少將軍您帶兵到達金廈，肯定會有很多人踴躍響應，攻下金廈將輕而易舉。而若是等到王寅聞信帶著水師返回，咱們再想打下金廈難如登天。」陳永華如是勸道。
鄭森仔細一想，深以為然：「若非你的提醒，森幾乎喪失了大好時機。永華，你便在我軍中擔任參軍吧。」
於是，十五歲的陳永華便得到了鄭森的信任，被委以參軍之要職！
當即，鄭森下令，全軍乘船北上，他要攻下金廈。
面對氣勢洶洶來攻的鄭森大軍，泉州總兵施琅如臨大敵。一邊派人往福州送信，一邊調兵遣將積極備戰。
雖然施琅手下有八千餘軍隊，戰船一百多艘，可他卻知道，手下的軍隊大都是原來的福建兵，大都出自鄭芝龍的手下，雖然經過了王寅的整編，但這麼短的時間想消除鄭家的影響根本不可能。
所以，雖然手中兵力不弱，施琅卻根本不敢出擊，而是選擇了固守金廈。
鄭森率領萬餘軍隊浮海而來，第一個進攻的便是金門島。
在料羅灣海面，鄭森督率軍隊和施琅率領的明軍展開了猛烈的廝殺。數百艘戰船混戰在一起殺聲震天。
而正如陳永華所料，鄭芝龍雖死，餘威尚在。看著鄭森船隊上空飄揚著的「鄭」字大旗，施琅手下很多官兵心情複雜至極。過去的十多年來，在這面旗幟之下，他們縱橫四海，北自倭國南到南洋，不管是倭人還是西夷以及南洋土著，無人敢不服！
而現在，自家人卻同室操戈，看著不遠處飄揚的旗幟，以及旗幟下的那名年輕的將軍，那可是南安侯的嫡子，鄭家的少主啊！
「他娘的，都是自家人還打什麼？」千戶周全斌怒吼著，下令所在船隻撤離戰場。
「施琅狗賊為了榮華富貴背叛了南安侯，去舔北人的溝子，咱們可沒得什麼好處，幹嘛為他賣命！」一艘三桅海船上，舶主陳魁也道，指揮著手下打起了白旗，向著戰場外圍撤去。
眼看著手下的戰船接二連三的撤退，施琅驚的渾身發抖。他手下的船隊本來就沒有鄭森多，現在很多人選擇的逃離戰場，如何還能堅持得住！
「總兵，咱們怎麼辦？」心腹手下將領高喊道。
「撤吧！」施琅長嘆了一聲，下令道。這種情況金門島已經守不住了，再打下去只有全軍覆沒一途。
施琅帶著十多艘船隻衝出鄭家船隊的攔截，徑直向著廈門逃去，廈門還留有三千軍隊，又靠近大陸，比孤懸海中的金門島更適合防守。
鄭森派陳輝、甘輝、曾德等將各率船隻緊追不捨，徑直向廈門追去。自己則率領部分船隻登陸金門島，同時派人招撫施琅手下的周全斌、陳魁等軍隊。
先說施琅，帶著僅剩的十多艘戰船向著廈門逃去。金門廈門相距也就二十餘里，很快便趕到了廈門。施琅海戰大敗，知道想靠著水戰擊敗鄭森已不可能，現在唯一能做的便是棄船上島，靠著島上的防禦設施死守。
而施琅之所以選擇死守廈門還有一個原因，那就是鄭家的家眷，鄭芝豹鄭襲，乃至鄭森的妻子都被關在廈門，只要手中有鄭家人作為人質，施琅料想鄭森也不敢強攻廈門！
「只要回到廈門，立刻把鄭芝豹還有鄭森的母親老婆孩子拉到碼頭，我看鄭森他還敢不敢進攻！」施琅對著手下獰笑道。
船隊很快逃回了廈門，施琅正好下令棄船上岸之時，卻見身邊的親衛驚恐的指著島內：「總兵快看！」
施琅連忙看去，便見到島內一股黑煙升起，直衝雲霄！
廈門生變！施琅就覺得腦袋翁的一聲，身體禁不住搖晃了起來。
「總兵咱們怎麼辦？」手下驚慌的問著。
施琅定了定神，吩咐道：「派幾個人上島去看看發生了什麼，傳令所有船隻準備作戰，阻擋追擊的叛軍！」
既然到了廈門，施琅對以鄭森家眷威脅鄭森還抱著希望，所以才沒有下令繼續逃跑。可擔心島上局勢不可控，害怕棄船之後再也無法逃跑，施琅也不敢逃到島上。那麼，就只有先頂住追來的船隻，派人去看看島上到底