美代子和龍彥得救了。
說是得救了，也只是象個丟了魂兒的軀殼而已。特別是龍彥，遭受了成年累月的苦難折磨，心身都受到了嚴重的損傷，將需要一個較長的恢複期。小山田博士把這兩個孩子送到可靠的醫院，祈望他們能早日康復出院。如今，龍彥已成了孤兒，博士對他就象慈父般地加以疼愛。
小山田博士經過一番周折，總算平安地換回了人質。但遺憾的是又讓大猩猩男爵跑掉了。在這件事上，他還是受到了社會上的不少責怪。博士每當聽到有人議論他「為了愛護自己的孩子而放走了大壞蛋大猩猩男爵」的時候，心裡確實不是滋味。因此，小山田博士便暗下決心：必須儘快抓到大猩猩男爵，使社會上的人們得以安心。於是，不分晝夜地進行活動，結果，使得他明顯地消瘦下來。人雖然消痩了，但工作卻進展得頗有眉目。
首先是博士經過冥思苦想，終於把青沼春泥在臨死時所透露出來的「七口鐘，七尊聖母，七個箱子」的「謎」給解開了。
緒方醫生當被一個斜眼人帶進一個奇怪的房子時，曾聽到過教堂的鐘聲……緒方醫生根據聽到的鐘聲，判斷那就是古柳男爵的府邸，並且向等等力警部作了報告。可是，後來經過警方的一再偵查，判明地處古柳男爵府邸近旁的高輪教堂的鐘，當時因出現裂紋並沒有響。那麼，緒方醫生該夜所聽到的鐘聲，究竟是來自何處呢？
另外還找出一個線索。那就是曾被斜眼人誘騙過的那個東京數一數二的著名洋服手藝人，曾被迫為古柳男爵做了與他所穿的洋服、斗篷完全相同的另一套服裝。據那個手藝人所說，他被帶進去的房子，也同高輪的古柳男爵府邸一模一樣。但是奇怪的是當他被帶去的那個時刻，高輪的古柳男爵府邸已被警方嚴密地監視起來，別說大猩猩男爵，就是其他任何人也絕對不可能進去，甚至連一個螞蟻也別想隨便出入。
針對上述蹊蹺事實，小山田博士經過反覆推敲估計到，可能在其他地方還有一所與高輪的古柳男爵府邸完全相同的房子。但是，連做夢也沒想到這種相同的房子竟然有七所。啊！竟然有七所完全相同構造的隱藏所！這種狡兔三窟的陰險用心，除了古柳男爵這種奸詐的惡人，誰又能想得出來呢？
但是，通過小山田博士的這一剖析，也就不那麼複雜困難了，因為已有了明顯的目標——在七所隱密的房子附近都有教堂，而且在這些教堂里都有音色相同的鐘聲。目前，在這七所房子中已弄清了兩所——高輪的古柳男爵府邸和砂町的木常醫院，其餘的五所，只要能發現教堂，也就可以找到。
小山田博士委託等等力警部把東京市內所有的教堂，來一次一個不漏的大清查。結果，終於查到了另外的四所教堂，而且都具有相同音色的鐘。經過搜查，證明了在這些教堂的附近也都有與古柳男爵府邸完全相同的房子，而且在這些教堂與房子之間，都構造有秘密的地道。
「七口鐘，七尊聖母，七個箱子。」這一令人費解的謎語，現在已經完全解開了，顯然是說，古柳男爵把他所盜竊的寶石裝進了七個箱子，藏在了七所教堂里的七尊聖母的供台下面。
在這次徹查中，已經發現了七所教堂中的六個，剩下的最後一所究竟在哪裡呢？等等力警部儘管竭盡全力地搜查，可還是未能發現。而且，在發現這六所教堂的時候已為時過晚，原來藏在聖母供台下的寶石箱，已經全被轉移了。
啊，剩下的最後一處隱藏所，究竟在哪裡呢？
小山田博士認為，事到如今也不能什麼都依賴警方，自己也要動手調查。所以把恭助、史郎和小胖子全都動員起來，在他的書齋里幾個人圍著東京市的全圖，全神貫注地在搜尋著每一個可疑點。正在這時，等等力警部來到了小山田博士家。
博士看出了警部那充滿憂慮的臉色，問了一句：
「啊，等等力君，又有了什麼新線索叫？」
警部搖了搖頭，說：
「不，還沒有找到另一處的隱藏所。不過，今天倒發生了另外一件非常奇怪的事。」
「奇怪的事？……」
「是的。先生，請您看看，這是什麼？」
等等力警部掏出了一個皮夾子，大小有明信片那麼大。博士好奇地打開皮夾子一看，裡面裝有六支試管，而且都用蠟密封著。
「這……這是什麼？」
當博士要伸手拿出試管時，警部急忙制止說：
「先生，小心！要弄破了試管，可就不得了啦。」
大家看到警部那種過於擔心的樣子，又仔細地看了看試管，又都以驚異的神色注視著警部的臉。
小胖子突然發出一聲怪叫：
「哎呀，警部叔叔，這……這裡面不是跳蚤嗎？」
也難怪大家都感到驚訝，在這六支試管中，每隻都有十五、六隻蹦蹦跳跳的跳蚤。
「是的，小胖子，試管里裝的都是跳蚤。但跳蚤是跳蚤，可又不是一般的眺蚤。先生，這都是帶有鼠疫菌的跳蚤。」
「什麼——鼠疫菌？」
大家不由得吸了一口涼氣。
傳染病中最可怕的是鼠疫，而鼠疫則是由老鼠傳染的，這是人人皆知的事。老鼠身上的跳蚤是鼠疫傳播的媒介，這些吸了病鼠血液的跳蚤又會成為向社會上傳播鼠疫菌的媒介。所以，一旦發現了鼠疫，首先要消滅的就是老鼠，再就是要消滅跳蚤。
「好啦，等等力君，你快講講，你是從哪裡弄到這些東西的？」
「先生，我給您講，事情的原委是這樣的——」
據警部所說：在淺草有個名叫萬吉的很出名的竊盜。這個皮夾子就是萬吉在國營電車的有樂町車站，從別人的兜里掏出來的，可是他運氣不佳，正碰上刑事警察在旁邊，當場就被逮捕了。可是奇怪的是，當刑事警察喊住被偷的人，給他看過皮夾子時，那個人卻搖著頭驚慌地逃走了。
「什麼，逃走了？」
「是，是的。刑事警察也沒想到被偷的人卻會逃走，當時由於人多、又是剛抓到萬吉……結果被他溜掉了。因而，警察認為這個皮夾子可能有什麼秘密，便把它送到警視廳。」
「你們問過學校或醫院了嗎？」
「當然問了，可是都說沒丟過這種東西，並說也不會叫人帶著這種危險東西上街。因此，從被偷的人慌張逃跑這一點來推測，在那個人的背後可能有鬼，於是……」
「於是怎麼啦？」
「提訊了萬吉，問了一下被偷人的相貌，說是那個人戴著鴨舌帽和墨鏡、萬吉在要下手的時候偷看了一下他的眼睛，說他是個極度的斜眼兒……」
「什麼！斜眼兒？」
史郎和小胖子情不由己地從旁插問了一句。小山田博士也吃驚地說：
「等等力君，這麼說那個傢伙就是大猩猩男爵的手下人蛭池嘍！」
「是的，是蛭池。」
「不過，等等力君，說是象斜眼兒，不一定就是斜眼兒蛭池吧。社會上斜眼的人也不算少啊！」
「不，絕對不是別人。因為萬吉從那個人兜里所掏出來的不只是皮夾子，還有這樣一個東西呢！」
警部拿出來的是一張照片，大家一看這張照片幾乎連呼吸都變得急促進來。那不正是怪獸王、大猩猩男爵嗎？
啊，一個多麼可憎的大猩猩男爵！看他那身穿洋服、外披黑斗篷、頭戴高筒帽、手拿文明杖的打扮，齜著牙笑的臉相，簡直是一張無法形容的令人恐怖的照片。
大家沉默地看了一會兒照片，接著小山田博士便毅然決然地斷定：
「既然他拿著這張照片，毫無疑問就是蛭池。不過，蛭池為什麼要拿著這種帶有鼠疫菌的跳蚤呢？……」
「難道先生把前些日子在深川發生鼠疫的事給忘了嗎？……說不定那就是大猩猩男爵……」
恭助、史郎和小胖子聽到這裡，嚇得臉色幾乎都變白了。小山田博士的臉色也象失去了血色，不斷地點著頭。
「是的，我也正想到了這一點。大家可能還記得古柳男爵曾經說過：一定要對使自己遭受這種下場的社會進行報復。可是直到現在，他還沒有找到機會下手。上次在五十嵐家引起的騷動，是由於我們有意識把那傢伙引誘出來而造成的，並不是由他自己主動採取的行動。所以，我一直也正在等待著，看看那傢伙究竟會搞出什麼鬼名堂來，現在事實證明他要散播鼠疫菌……是多麼可怕的兇狠行動呀！等等力君，我們必須防止鼠疫的蔓延，不能讓他的陰謀得逞。不管有什麼困難，也要制伏他。」
說到此，小山田博士砰地敲了下桌子。
「先生，您說防止，究竟怎樣才能防止呀？」
「要說防止，當然，首先要請市裡的防疫科立即採取緊急措施。但根本的解決辦法，還是要儘快抓住古柳男爵，把他關進監獄，永久不讓他再在社會上幹壞事。」
「當然，能抓住他是再好也沒有了，不過目前連他的住